Системата за генетичен анализ MassARRAY 4 сама по себе си е алтернативна и високо надеждна платформа за точен анализ на мутации, използвайки таргетно генотипизиране, както и за анализ и проверка на данните, получено с помоща на NGS. Новата, по-малка версия на генетичния анализатор MassARRAY 4 е предназначен за работа в 24 гнездов тип – тя е достъпна рентабилна система за по-малките изследователски лаборатории.
Генетичния анализатор MassARRAY 4 в 24-алвеолен формат:
- Компактният мас-спектрометър е за прецизен , надежден, чувствителен анализ на нуклеинови киселини.
- Ниска себестойност на анализа
- Гъвкавост – както в анализите на протоколите така и при използването на пробите чип (два чипа за всяко стартиране, способността за ъпгрейд до 96- и 384- алвеоларни формати)
- Бърз и автоматизиран набор от инструменти. Добавяне или премахване на мутации и предпочитани маркери.
- Максимално прост работен процес с ръчно откриване на чипа.
- Вградена камера за поставяне на пробата и баркод четец
- Високо чувствителен метод позволява да се определи нискочестотни алели (0,1%) – идеалното решение за анализ на хетерогенни тумори, както и свободно циркулиращи туморни клетки и деградирала ДНК в плазмата
Основни области на приложение:
- Генотипизиране
- Профилиране на соматични мутации
- Свръхчувствителни профилиране соматични мутации
- Анализ на метилация
- Количествен анализ на генната експресия и брой генни копия
24 – алвеоларен генетичен анализатор MassARRAY 4 е оптимален за генетични изследователски лаборатории с малък обем проби. По време на едно пусканеможе да се изследват едновременно два чипа. По време на работния ден може да се анализира повече от 6 чипа.
Описание
Гъвкава система за генетичен анализ на базата на масова спектрометрия MassARRAY 4 позволява да се изследва ДНК в широк диапазон за различни приложения.
Генотипизиране
Генетичния анализатор MassARRAY 4 се използва за високо прецизно картиране и валидиране, както и в мащабни изследвания на геноми така и в разработването на рутинни генетични тестове за различни задачи, като например определянето на биологичния материал, генетичната профилиране на различни заболявания и т.н.
Благодарение на он-лайн поддръжка на сървъра за приложения, може независимо да се разработи изследване, да се създаде собствен мултиплексни анализи или да се поръча готов панел.
- iPLEX Панели Pro Sample ID: Скрининг на ДНК, извлечена от фиксирани с формалин парафинови проби, клетъчни линии и / или тъкани да идентифицират грешни проби, дублиращи проби и / или идентификация проби и тест на ДНК проба анализирана преди генотипизиране.
- iPLEX ADME PGx Pro Фармакокинетични групи: скрининг на SNP, които могат да повлияят на абсорбцията, разпределението, метаболизма и отделяне на лекарствени средства. Панелът обхваща 191 от най-биологично надеждните фармакогенетични маркери в 36 гени.
Hemo ID Панел: за генотипизиране на кръвни групи: позволява генотипиране на 101 антигени за 16 системи за определяне на кръвната група, плюс 23 антигени на тромбоцитите и неутрофилите.
Профилиране на соматични мутации
Фирма Agena Bioscience създаде цялата гама на специални онкологични панели на базата на IPLEX комплекти, които допринасят за оптимизира фундаментални и клинични изследвания.
- OncoCarta Panel: потвърждаване на мутационнитепрофили
за туморни проби и 19 основни онкогени. - OncoFOCUS Panel: групата съдържа валидирани мутационни профили за анализ на следните клинично значими гени: BRAF, EGFR, KRAS и NRAS.
- LungCarta Panel: профилиране на аденокарцином на белите дробове туморни проби за определяне на конкретния тип заболяване
- LungFUSION AbA Panel: откриване на транслокации в туморните проби с недребноклетъчен рак на белия дроб, скрининг за гени ALK, ТВЕ и ROS1
Изследователят може да направи свой собствен анализ на протокол като използва онлайн ресурса Assay Design Suite.
Свръхчувствително профилиране на соматични мутации
Фирма Agena Bioscience е разработила специална техника и пусна нов набор от реактиви UltraSEEK, които позволявт а ефективно насочен мултиплексен анализ на редки мутационни прояви. Методът е с висока чувствителност, която може да открие мутации при честота на възникване на 0.1%. Можете да поръчате готова група или да се разработи собствен мултиплексен и протокол за изследване с помоща на онлайн ресурс за развитието на експеримент за анализ Assay Design Suite.
- UltraSEEK Oncogene Panel: открива 26 известни мутации с честота на поява на ≤ 1% в смесени туморни образци, плазмени проби. Идеалното решение за анализ на свободно циркулиращи клетки.
Анализ за метилиране
Въз основа на платформата MassARRAY 4 се извършва количествен анализ на метилирана ДНК, използвайки специфично нуклеотидно разцепване. Софтуерото обезпечаване на EpiTYPER протокол осигурява удобно решение за анализ и експорт на данни
Количествена генна експресия (QGE) и анализ на брой генни копия (STM)
Системата MassARRAY 4 точно и ефективно извършва количествен анализ на експресията на няколко последователности. Повече от 24 цели могат да бъдат едновременно анализирани в един мултиплекс, който е най-оптималното решение за рутинни изследвания.